In den Schnittlisten stehen nur die Stellen drin an denen geschnitten werden soll. Dadurch kann gar keine Asynchronität hervorgerufen werden. Wenn diese geschnittenen Dateien doch asynchron sind, und die ungeschnittenen synchron, dann liegt höchstwahrscheinlich eine Fehlkonfiguration auf dem Computer auf dem das Schnittprogramm läuft vor.
Wolltest du mit dem Thread dich selbst dazu aufrufen das Schneiden einzustellen?