Ich habe das gleiche Problem mit mldonkey. Ca. 6 GB hochgeladen aber davon wurden nur 530 MB von OTR anerkannt.
Ich habe den Verdacht, dass aus irgendeinem Grund Uploads von OTR Dateien die schon vollständig geladen wurden, nicht mehr angerechnet werden. Außerdem scheint mldonkey Uploads von pausierten torrents nicht zu zulassen.
Schade eigentlich. Mldonkey lässt sich recht bequem bedienen und Platz auf der Festplatte habe ich auch noch.