diese meldung bedeutet im normalfall, dass die aufnahme von tonspur und videospur nicht exakt gleichzeitig gestartet wurden und es deswegen zu einer verschiebung kommt, die durch ein späteres starten einer der spuren wieder ausgeglichen werden muss.
ich kann nur empfehlen die betroffenen dateien mit CutAssistant zu schneiden, da dieser problemlos springen sowie anschließend mit VirtualDub schneiden kann.
direkt in VDub kenne ich leider so auf die schnelle keine lösung...