Soweit ich weiß, tritt kein Qualitätsverlust auf.
Da die Videos eine variable Bitrate haben könnte ich mir das so erklären:
Die Werbung enthält viele Bildwechsel und viel Bewegung, daher wahrscheinlich eine im Vergleich zum Film höhere durschnittl. Bitrate. Wenn du die nun rausschneidest, sinkt natürlich die durchschnittl. Bitrate des gesamten Films auch.
Das der Unterschied so eklatant ausfällt, hätte ich allerdings nicht gedacht... Ich habe auch keine Ahnung, ob das stimmt, was ich hier verzapfe, es erscheint mir aber Plausibel, da bei der Copy-Schneiderei, wie du richtig vermutet hast, eigtl. nichts verändert wird.