Die Unterschiede, ob man mit Avidemux oder VirtualDub schneiden sind glaube ich sehr gering. Mir ist schon lange keine cutlist mehr aufgefallen, die nicht gepasst hat, weil sie mit dem jeweils anderen Programm erstellt wurde. Wenn's doch nicht ganz passt (evtl. mal eine Hand voll flasche(s) Frame(s)), dann musst du halt schnell umstellen und nochmal schneiden - geht ja fix.

Du kannst entweder mit Avidemux erstellen und mit einem der beiden hier im Forum vorgestellten Konverter umwandeln, mit VirtualDub erstellen und konvertieren, oder mit dem VirtualsDub Cutlist-Mod erstellen, da kannste direkt als cutlist speichern und sparst dir das umwandeln...